O Congresso Nipo-Brasileiro, evento tradicional da FMB há 30 anos, tem como objetivo a integração de alunos das escolas médicas do Japão (Keio University) e da Faculdade de Medicina de Botucatu (Unesp).
O evento é realizado por alunos, que irão apresentar três temas iguais, relacionados ao Japão e ao Brasil, proporcionando conhecimento e trocas de experiências internacionais.